Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 C16orf62-216ENST00000543152 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ARHGAP15-201ENST00000295095 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 HACD3-211ENST00000569894 1471 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NLGN1-202ENST00000401917 1827 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SKP257-201ENST00000364525 309 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SAMD13-203ENST00000370670 565 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SMPX-201ENST00000379494 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL033519.1-201ENST00000407266 307 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL356968.2-201ENST00000412769 1257 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PCNPP4-201ENST00000414817 517 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MTCO2P23-201ENST00000425216 680 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC245884.2-201ENST00000426257 404 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC234771.4-201ENST00000441416 730 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC079922.1-201ENST00000443291 359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC009518.1-201ENST00000452219 559 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RPL31P11-202ENST00000454082 372 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BBOF1-202ENST00000463558 550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 WDR78-207ENST00000488333 613 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC122714.1-201ENST00000502510 459 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC131254.2-201ENST00000521908 550 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC131935.1-201ENST00000524621 333 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP001636.2-201ENST00000525517 696 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC007923.1-201ENST00000577970 505 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC01841-201ENST00000586698 573 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005332.4-201ENST00000592752 579 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP000654.1-201ENST00000602510 1192 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL391095.2-201ENST00000615228 378 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RSU1P2-204ENST00000619977 1240 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 BRCC3-209ENST00000620502 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR7159-201ENST00000620587 66 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC068213.1-201ENST00000625124 226 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 VIPR1-AS1-221ENST00000626992 602 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 CLUHP10-201ENST00000631979 980 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PLEKHA1-201ENST00000368988 3872 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF254-208ENST00000616028 3886 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 DDX6P1-205ENST00000441966 1436 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF761-203ENST00000454407 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AP001541.1-201ENST00000623322 1904 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RIMS2-209ENST00000507740 8002 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR10G4-202ENST00000641521 3623 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 TLR2-201ENST00000260010 4200 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 IL23R-201ENST00000347310 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC005480.1-202ENST00000555916 3548 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 LINC00698-203ENST00000468072 1957 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 EMC2-201ENST00000220853 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 OR2G3-201ENST00000320002 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 POU1F1-201ENST00000344265 1149 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RFPL3S-201ENST00000382084 1117 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AMZ2P2-201ENST00000406819 1057 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 PLGLB1-202ENST00000409310 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 IFNA17-201ENST00000413767 980 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 MIR205HG-206ENST00000440276 539 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
SH3BP4Q9P0V3 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.9 ms