Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AADAC-201ENST00000232892 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC012254.3-201ENST00000591183 2117 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CYP2C8-210ENST00000535898 1799 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PSMA3-201ENST00000216455 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL512353.1-202ENST00000416809 627 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RANP7-201ENST00000418085 644 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPL7AP51-201ENST00000422016 760 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC023245.1-201ENST00000468501 517 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GLUD1P3-202ENST00000508551 200 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC108103.1-201ENST00000511286 446 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL137224.1-201ENST00000527984 389 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL589935.1-223ENST00000587015 808 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL161457.2-206ENST00000592778 802 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC011478.1-201ENST00000593140 554 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC012370.2-201ENST00000597541 1080 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR51C1P-201ENST00000608504 942 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC073389.3-201ENST00000609434 935 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ELSPBP1-206ENST00000619003 893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC022400.9-201ENST00000623633 273 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FBXL21-201ENST00000297158 1305 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 PDE7A-201ENST00000379419 2425 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RBPJP7-201ENST00000442803 1447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RBPJP5-201ENST00000449433 1447 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ALMS1-IT1-201ENST00000441587 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 BBIP1-207ENST00000448814 2119 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC00598-206ENST00000615947 3541 ntTSL 4 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR51J1-201ENST00000332043 951 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RN7SKP78-201ENST00000364711 318 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC087752.1-201ENST00000391360 558 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL512622.1-201ENST00000414106 481 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL445465.1-208ENST00000419709 506 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC092865.3-201ENST00000425390 1026 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC092168.2-201ENST00000430586 717 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC005008.2-201ENST00000431501 715 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 TEX41-206ENST00000432608 661 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GUSBP6-201ENST00000434932 640 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC242426.1-201ENST00000435270 960 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC00867-203ENST00000445161 580 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC010240.2-201ENST00000445363 1205 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL590399.3-202ENST00000448491 495 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC092865.4-201ENST00000477936 615 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR7E157P-201ENST00000494376 911 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC080013.1-206ENST00000496842 712 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 OR7E99P-201ENST00000505750 922 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 CENPK-211ENST00000510693 1040 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC087286.2-201ENST00000558980 660 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 BPIFA4P-204ENST00000605211 656 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC096708.4-201ENST00000620563 552 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
TRAM2Q15035 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 150.9 ms