Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL645939.3-201ENST00000435408 225 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 UBE2L5P-201ENST00000436446 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC100823.1-201ENST00000442274 480 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LARGE-IT1-201ENST00000445391 558 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RBMY2EP-202ENST00000456360 940 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC239804.1-201ENST00000466343 869 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL079303.1-201ENST00000486611 463 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 KHDC1P1-201ENST00000511053 508 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ATP6V0E1-202ENST00000517669 502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC090424.1-201ENST00000535243 736 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 BMS1P16-201ENST00000556075 1147 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DAAM1-208ENST00000556135 582 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR4C49P-201ENST00000563891 900 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MIR6807-201ENST00000621968 92 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LARP7-210ENST00000509061 2332 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ANAPC1P1-201ENST00000426186 2145 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 MPDZ-204ENST00000381022 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 OR5B12-202ENST00000641921 1807 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 AC130304.1-201ENST00000622942 2385 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 LINC00309-201ENST00000431020 3307 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
SMCO1Q147U7 ATP5J2-201ENST00000292475 607 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR4F21-201ENST00000320901 995 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SKP145-201ENST00000363291 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL731684.1-201ENST00000415530 439 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL21P50-201ENST00000417698 477 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC01006-207ENST00000458645 738 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPL12P31-201ENST00000478433 450 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC02503-201ENST00000510505 812 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC025871.2-201ENST00000522589 511 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP001267.3-204ENST00000528578 423 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ARL17A-205ENST00000573185 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ARL17B-206ENST00000575698 581 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC011476.3-202ENST00000586845 553 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC006305.2-201ENST00000589617 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 uc_338.33-201ENST00000614988 170 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AL355974.3-201ENST00000617383 467 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC027506.1-201ENST00000621395 198 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 SNHG5-214ENST00000623001 598 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC015660.5-201ENST00000623238 564 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 PIP5K1B-201ENST00000265382 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZMAT1-201ENST00000372782 3185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC124312.1-201ENST00000551312 1325 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LINC00824-203ENST00000520206 2055 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 CASC17-201ENST00000569074 2059 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 LYRM2-208ENST00000523377 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
SMCO1Q147U7 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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