Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 MXRA7-207ENST00000592148 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LPL-201ENST00000311322 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU1-16P-201ENST00000365477 164 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SNORA10-201ENST00000384084 133 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RANP6-201ENST00000413691 644 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01723-201ENST00000432244 601 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 IGKV6D-21-201ENST00000436451 409 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC007064.2-201ENST00000442403 500 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL035416.1-201ENST00000443012 767 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC093157.1-202ENST00000446527 1045 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PPP1R8P1-201ENST00000452549 1044 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL590490.1-201ENST00000455599 316 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 SULT1D1P-201ENST00000458020 882 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC108159.1-201ENST00000505408 489 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC112225.1-201ENST00000508230 297 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC02223-203ENST00000514771 781 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC091982.1-201ENST00000518134 520 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RBMS2P1-201ENST00000525031 1226 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL359212.1-201ENST00000556608 614 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 STX8-209ENST00000574431 731 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC010761.2-202ENST00000582536 391 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC011193.2-201ENST00000582638 367 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC011933.4-201ENST00000585081 403 ntTSL 3 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF75A-210ENST00000617839 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL121985.3-201ENST00000620690 523 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 C3orf79-201ENST00000623038 580 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 UQCRC2-213ENST00000630839 535 ntTSL 4 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PPP3R2-202ENST00000636434 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ASNS-214ENST00000455086 1588 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ERV3-1-201ENST00000394323 2719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MAPK10-285ENST00000641207 2746 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RSC1A1-201ENST00000345034 1854 ntAPPRIS P1 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KIAA1328-202ENST00000586135 1863 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPL7L1-208ENST00000493763 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 GBA3-203ENST00000508166 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ACTA2-AS1-201ENST00000437930 2450 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNF41-212ENST00000615206 5216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL020995.1-201ENST00000427524 1680 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC092725.2-201ENST00000567658 1389 ntBASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BBS12-201ENST00000314218 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RAB2B-201ENST00000397762 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MELK-207ENST00000536860 2342 ntTSL 2 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 BBOX1-205ENST00000529202 1725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 KIF6-208ENST00000538893 2386 ntTSL 5 BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC00347-202ENST00000594461 2371 ntTSL 1 (best) BASIC7.44□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 LINC01822-201ENST00000435682 2098 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SKP23-201ENST00000625159 4301 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 PRCP-202ENST00000393399 2120 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 VLDLR-AS1-201ENST00000416826 3167 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC130464.1-201ENST00000416201 1500 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL031594.1-201ENST00000417123 1932 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 NR2F1-AS1-208ENST00000606233 2264 ntTSL 2 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MUC3A-203ENST00000483366 9944 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNA5SP448-201ENST00000363151 111 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RNU4-31P-201ENST00000384211 141 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MIR138-2-201ENST00000384916 84 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RN7SKP30-201ENST00000411373 334 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CYTOR-207ENST00000414584 772 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC108681.1-202ENST00000417384 589 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC096570.1-201ENST00000419013 569 ntTSL 4 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AL157884.1-201ENST00000424561 454 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 ICA1L-210ENST00000425178 879 ntTSL 1 (best) BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AKR1B10P1-201ENST00000425765 942 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 MYO5BP3-201ENST00000431872 1279 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 CDC42P2-201ENST00000448566 569 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC7.43□□□□□ -1.22
CLN3Q13286 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC7.43□□□□□ -1.22
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