Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF235-204ENST00000589799 955 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC015982.1-201ENST00000608113 465 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC127071.2-201ENST00000623293 527 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 HSPA8P14-201ENST00000552265 1805 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ALB-220ENST00000621628 1606 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 FIRRE-202ENST00000637577 1635 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 OPRM1-206ENST00000419506 1402 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL360014.1-201ENST00000562922 2084 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 N4BP2L1-209ENST00000530622 1897 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 CCR6-201ENST00000341935 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP130-201ENST00000364924 301 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 USMG5-203ENST00000369811 635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC115283.1-201ENST00000427353 400 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RPS3AP49-201ENST00000472161 790 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RPL24-206ENST00000495401 478 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC091819.1-201ENST00000518330 630 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL357153.3-201ENST00000553982 611 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RN7SL475P-201ENST00000583379 298 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC004805.3-201ENST00000603178 310 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC141002.1-201ENST00000607025 279 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC012676.3-201ENST00000614983 479 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PPARGC1A-201ENST00000264867 6318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 GLIPR1L2-202ENST00000378692 1903 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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CCDC173Q0VFZ6 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL158832.1-201ENST00000429661 406 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC009227.2-201ENST00000432599 511 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 LINC01350-202ENST00000439633 623 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
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CCDC173Q0VFZ6 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC078785.1-205ENST00000491578 482 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MBNL1-219ENST00000492948 1054 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC116345.3-201ENST00000508255 449 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 UGT2A3P7-201ENST00000510485 734 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RN7SKP64-201ENST00000517206 328 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 PYDC2-201ENST00000518817 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 IGHV4-55-201ENST00000520889 368 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AL359232.1-202ENST00000556874 1206 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RORA-AS2-202ENST00000561413 576 ntTSL 4 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC024361.3-201ENST00000570919 333 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC211486.2-201ENST00000576046 280 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC090415.2-201ENST00000584078 374 ntTSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC006305.3-201ENST00000590589 454 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MIR6862-1-201ENST00000613016 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MIR6862-2-201ENST00000614755 70 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC241377.1-201ENST00000619797 406 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 RNASE11-211ENST00000620912 883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 AC021766.1-201ENST00000624404 741 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 MIA3-203ENST00000344922 8142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
CCDC173Q0VFZ6 DYNC2LI1-201ENST00000260605 1399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
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