Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MDM4-203ENST00000367182 10073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CCDC186-203ENST00000369287 7245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 CAPN6-201ENST00000324068 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ZNF292-201ENST00000339907 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RNU1-59P-201ENST00000364829 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL626787.1-201ENST00000366136 594 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FO393401.1-203ENST00000416260 486 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC064862.4-201ENST00000442180 334 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 YWHAEP1-201ENST00000453697 763 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC246785.3-201ENST00000455105 314 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC023141.9-201ENST00000458734 412 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 PFN1P6-201ENST00000476786 399 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC021733.2-201ENST00000518830 497 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 ANKRD49-206ENST00000540349 573 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 GNG2-208ENST00000554875 430 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 SNORD95-201ENST00000579879 68 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC104984.1-201ENST00000581633 697 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 RPL12P48-201ENST00000605620 304 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 U1.34-201ENST00000618578 162 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 FP236241.1-206ENST00000625005 987 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR11H2-202ENST00000641517 1085 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 OR8G3P-202ENST00000641572 1255 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
CDKN3Q16667 MECOM-209ENST00000472280 3593 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ELAVL4-202ENST00000371819 2467 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CEP152-201ENST00000325747 4986 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 STRBP-204ENST00000447404 6161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RARSP1-201ENST00000542842 1418 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MIR4435-2HG-207ENST00000439362 1522 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL662795.2-201ENST00000624252 3706 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 C17orf105-201ENST00000449302 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SMIM21-203ENST00000584508 2554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ETF1-203ENST00000503014 1736 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SLC4A8-202ENST00000358657 11731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CLASP2-205ENST00000461133 4814 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LYPD6B-201ENST00000280115 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 FUNDC2P3-201ENST00000334716 533 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RNASE11-202ENST00000398009 1034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC00463-201ENST00000413501 1147 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL513325.1-201ENST00000417716 1034 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL008723.2-201ENST00000426354 562 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL512637.1-201ENST00000439523 1231 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 OSBPL10-AS1-205ENST00000444503 526 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RPSAP37-201ENST00000470913 821 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 RN7SL177P-201ENST00000476596 299 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MOSPD2-206ENST00000497603 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC108941.2-201ENST00000506796 716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL049840.6-201ENST00000604583 345 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL160400.1-201ENST00000606385 1030 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL512624.1-201ENST00000613638 469 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 IPO5-229ENST00000631030 192 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GABRB2-201ENST00000274547 7409 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZSCAN4-202ENST00000612521 1979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 GPX8-201ENST00000296734 3245 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 TMPRSS11F-201ENST00000356291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AL161756.3-201ENST00000641216 2071 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 MTOR-202ENST00000376838 4017 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
CDKN3Q16667 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms