Protein–RNA interactions for Protein: Q12947

FOXF2, Forkhead box protein F2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF2Q12947 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORD16-201ENST00000362803 99 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC117402.1-202ENST00000383686 820 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL139805.1-201ENST00000407837 289 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 C9orf147-201ENST00000412934 584 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL138831.1-201ENST00000415144 209 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPL7AP14-201ENST00000424041 802 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL139415.1-201ENST00000424862 352 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL513329.1-201ENST00000426575 657 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KCTD9P1-201ENST00000430462 1167 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MAJIN-202ENST00000432175 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008063.2-201ENST00000432251 619 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC112492.2-201ENST00000432774 1030 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC069154.1-201ENST00000432914 542 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AMYP1-201ENST00000440059 1023 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL136988.2-201ENST00000440729 861 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 PMS2P9-201ENST00000441237 515 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNAP25-AS1-204ENST00000451151 867 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL358876.1-201ENST00000453364 1075 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC116562.1-201ENST00000485355 781 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC090543.1-201ENST00000492168 485 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SKP98-201ENST00000517070 156 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TXNRD1-212ENST00000526390 3808 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP001318.3-202ENST00000528876 509 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC103740.1-202ENST00000558404 542 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP001496.3-201ENST00000580230 913 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SETP3-201ENST00000581726 813 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC079315.1-201ENST00000602952 623 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP002345.2-201ENST00000609961 904 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC025262.3-201ENST00000623666 360 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP003499.2-201ENST00000624100 483 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01206-233ENST00000630063 878 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR7E91P-202ENST00000642062 1198 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF91-202ENST00000397082 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SMG1-201ENST00000330588 1588 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NEK2P2-201ENST00000438441 1338 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SPINK5-203ENST00000398454 2915 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 B3GALT5-203ENST00000380620 13170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL359195.2-201ENST00000623657 4412 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MRPS27-201ENST00000261413 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF211-205ENST00000391703 2239 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF727-201ENST00000456806 1679 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC125238.2-201ENST00000430003 1440 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 ABLIM1-202ENST00000369252 7690 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LINC01751-201ENST00000569178 1770 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 L3MBTL3-201ENST00000361794 4217 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AC099654.3-201ENST00000447087 1546 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 NKRF-204ENST00000542113 3351 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 G6PC-201ENST00000253801 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SYNE2-216ENST00000555002 11532 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 LRRIQ3-201ENST00000354431 2849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 MOB4-201ENST00000233892 3785 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 CPED1-206ENST00000450913 2501 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 TSLP-201ENST00000344895 736 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL445224.1-201ENST00000420595 737 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
FOXF2Q12947 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms