Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AL353804.1-201ENST00000444482 451 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MIS18A-AS1-201ENST00000453549 769 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 Z83838.1-202ENST00000456225 839 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 RN7SL170P-201ENST00000487098 295 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC239584.1-201ENST00000510419 732 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC006530.1-201ENST00000555980 571 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL135838.1-201ENST00000556080 235 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AL356801.1-201ENST00000559320 294 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MIR4271-201ENST00000582451 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MUT-201ENST00000274813 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 PRR14L-201ENST00000327423 10826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ENKUR-201ENST00000331161 3382 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 POSTN-204ENST00000379749 3210 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MCMDC2-204ENST00000422365 5096 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.78□□□□□ -1.48
TTPAP49638 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.48
TTPAP49638 MFSD8-239ENST00000641590 2479 ntBASIC5.77□□□□□ -1.48
TTPAP49638 ZNF682-201ENST00000358523 2161 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ANO4-202ENST00000392979 3909 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CACNB4-203ENST00000397327 2112 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC090616.2-201ENST00000358484 431 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL136131.2-201ENST00000424283 348 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC00383-201ENST00000433664 817 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC006019.3-201ENST00000446335 698 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AP002884.1-201ENST00000479691 655 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC02006-201ENST00000488210 524 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC092666.1-203ENST00000495144 698 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 HAND2-AS1-235ENST00000515376 951 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNA5SP473-201ENST00000516402 125 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AP000424.2-201ENST00000523784 233 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TTN-AS1-226ENST00000588716 604 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ATM-229ENST00000639953 587 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC02421-201ENST00000542219 3135 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 ZNF493-202ENST00000355504 4386 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 MPDZ-208ENST00000447879 6262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC006288.1-201ENST00000565320 1463 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC137056.2-201ENST00000624055 1958 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 EXOC1-201ENST00000346134 3357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CLEC2D-202ENST00000261340 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 BPY2-201ENST00000331070 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 BPY2C-201ENST00000382287 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 BPY2B-201ENST00000382392 1206 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LYST-AS1-201ENST00000412098 521 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RNGTTP1-201ENST00000420965 728 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CA1-201ENST00000431316 1232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC211433.1-202ENST00000434256 1187 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AL158850.1-201ENST00000441249 914 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 OR7E116P-201ENST00000448529 957 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC090058.1-201ENST00000498788 435 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC074255.1-201ENST00000511259 501 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 GOLT1B-205ENST00000540141 1055 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC107958.1-201ENST00000556576 290 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC5.76□□□□□ -1.49
TTPAP49638 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.7 ms