Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 AC016027.4-201ENST00000450866 277 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC114324.2-202ENST00000503812 134 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC115622.1-201ENST00000509628 587 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC135983.3-201ENST00000528049 1226 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC137590.1-201ENST00000542422 495 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC037479.1-201ENST00000558361 625 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC093524.1-201ENST00000564266 1094 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC024267.3-201ENST00000579673 562 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 Z93930.3-201ENST00000607919 749 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MIR6503-201ENST00000622884 86 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AF127577.4-201ENST00000432230 5929 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LRRC7-202ENST00000310961 6507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MANSC1-204ENST00000545735 1501 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ASXL2-203ENST00000435504 12878 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 CHMP1B2P-202ENST00000614414 6813 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 KDM3B-209ENST00000542866 3634 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 FAM83B-201ENST00000306858 3167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 CENPN-203ENST00000393335 1556 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 PLCXD3-201ENST00000328457 7538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 TRDC-201ENST00000390477 720 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LINC01889-201ENST00000430692 668 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC069277.1-205ENST00000432743 630 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AL133247.1-201ENST00000435713 646 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 OR3D1P-201ENST00000438288 955 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ZNF619P1-201ENST00000446539 752 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 TFP1-201ENST00000460564 572 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RN7SL790P-201ENST00000474043 298 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 TFP1-203ENST00000490470 561 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC016559.2-201ENST00000510759 359 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 IGLV3-24-201ENST00000517477 197 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC107909.1-201ENST00000523226 595 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 NATP-201ENST00000523491 878 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LGALS8-217ENST00000525042 903 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC124891.1-201ENST00000536322 519 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 LINC00640-204ENST00000557295 708 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 RN7SL657P-201ENST00000582431 293 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC068726.1-201ENST00000610993 341 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 Metazoa_SRP.94-201ENST00000612609 250 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AL035661.1-201ENST00000620459 1144 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC141930.3-201ENST00000640435 762 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC018717.1-201ENST00000457712 1505 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 TRPC4-203ENST00000358477 2955 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 MAPK6PS2-201ENST00000379571 2060 ntBASIC5□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
HLA-DQB1P01920 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
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