Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXM1

LRIG3, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG3Q6UXM1 NPM1P45-201ENST00000583151 559 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RPS4XP21-201ENST00000603814 750 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL078624.2-201ENST00000605063 554 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL591167.1-201ENST00000607321 456 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 BMS1P14-201ENST00000615056 606 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 CCDC62-205ENST00000537566 3537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 ATXN2-202ENST00000389153 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 OOSP2-201ENST00000278855 1633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC245100.4-202ENST00000634638 1342 ntTSL 5 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 KIAA1328-201ENST00000280020 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.16□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 TRPC4-202ENST00000355779 2784 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SCN1A-217ENST00000637988 8562 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RALGAPA1P1-201ENST00000443361 6232 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 OR2M7-201ENST00000317965 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 XAGE5-201ENST00000351072 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP69-201ENST00000365390 305 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 FAM183A-205ENST00000410048 500 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC084030.1-202ENST00000413385 880 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 NUTM2A-AS1-203ENST00000413961 501 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 ELOCP6-201ENST00000429066 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC079763.1-201ENST00000441295 738 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC009244.1-201ENST00000450566 258 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SLAMF6P1-201ENST00000451067 602 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 DIRC3-AS1-201ENST00000452813 557 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AP000547.1-201ENST00000454360 617 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL354872.1-201ENST00000456361 967 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RARRES2P3-201ENST00000457739 473 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 ELOCP12-201ENST00000458706 328 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SSBP1-205ENST00000465582 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SEPT7P9-201ENST00000475691 413 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 RN7SL369P-201ENST00000477138 299 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC018645.1-201ENST00000505003 109 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC093870.1-201ENST00000506837 213 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC027627.1-201ENST00000506895 753 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 IQCH-203ENST00000512104 1000 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SETP21-201ENST00000514799 892 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 SNORA70.17-201ENST00000516449 133 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC113423.2-201ENST00000517582 545 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC104997.1-201ENST00000519761 717 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC008601.1-201ENST00000519892 527 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC078864.1-201ENST00000547538 512 ntTSL 4 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AL161757.5-202ENST00000556696 570 ntTSL 3 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 ABHD15-AS1-201ENST00000581474 187 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.15□□□□□ -1.42
LRIG3Q6UXM1 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 LINC00032-203ENST00000640247 1374 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 ABI2-204ENST00000295851 22209 ntTSL 1 (best) BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 CFAP70-202ENST00000340329 1403 ntTSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC018628.1-201ENST00000624147 3819 ntBASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 NOL8-214ENST00000535387 3390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 GRXCR2-201ENST00000377976 2002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.15□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC011416.1-201ENST00000514947 1732 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 CLIP4-202ENST00000401605 2322 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 SDHAF3-201ENST00000360382 731 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP186-201ENST00000365371 303 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 RN7SKP81-201ENST00000365603 331 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 SPRR2B-201ENST00000368755 617 ntAPPRIS P1 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 SVIL-AS1-202ENST00000414457 1243 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 MEAF6P1-201ENST00000416092 327 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC107079.1-201ENST00000416509 669 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC002127.1-201ENST00000421305 225 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC016745.1-201ENST00000422178 508 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AL512363.1-201ENST00000425089 586 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
LRIG3Q6UXM1 AC096632.2-201ENST00000438139 1239 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms