Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ABCB11-201ENST00000263817 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AMY1B-201ENST00000330330 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GRIA4-204ENST00000428631 2778 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ADGRE1-202ENST00000312053 3128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MIR130B-202ENST00000385018 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TRAV35-201ENST00000390462 330 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PCBP1-AS1-224ENST00000429599 1045 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RPSAP65-201ENST00000429660 595 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC108051.1-201ENST00000435291 549 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC004994.1-201ENST00000447057 313 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL139350.1-201ENST00000448825 408 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HBBP1-202ENST00000454892 455 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC104339.1-201ENST00000465478 348 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RN7SL269P-201ENST00000467795 305 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC008680.1-201ENST00000523398 283 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 IGLV3-30-201ENST00000524362 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MS4A6A-210ENST00000529054 1160 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC089998.2-201ENST00000551856 277 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC009396.2-201ENST00000555954 700 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC138207.8-204ENST00000579588 527 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OSTC-205ENST00000613215 876 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC073488.3-201ENST00000631611 778 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 DNHD1-212ENST00000527990 14298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CASP5-208ENST00000526056 1344 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 KYNUP3-201ENST00000574386 1341 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RASSF8-216ENST00000615708 1328 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC015971.1-203ENST00000426549 1948 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC092646.2-201ENST00000431242 2095 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MDM4-216ENST00000616250 9597 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GCSAML-210ENST00000536561 4063 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 SPINK7-201ENST00000274565 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 GKN2-201ENST00000328895 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 IFNA8-201ENST00000380205 1039 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC002511.2-201ENST00000413796 450 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RPL35AP3-201ENST00000414680 288 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC099782.1-201ENST00000425889 474 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 NPSR1-AS1-206ENST00000439852 710 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 EIF4A2P2-201ENST00000455776 1070 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC104164.1-201ENST00000460282 590 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 RN7SL836P-201ENST00000476140 296 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC068633.1-202ENST00000476460 458 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC02485-202ENST00000511899 770 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC008957.1-202ENST00000512329 681 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 MAST4-IT1-201ENST00000514241 658 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 IGKV3D-25-201ENST00000519599 235 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC103853.1-201ENST00000520588 649 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 FAU-203ENST00000525297 355 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 AP003033.2-201ENST00000528901 805 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
PGGT1BP53609 LINC02420-201ENST00000543387 741 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 132.6 ms