Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 NLRP13-202ENST00000588751 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 ASAH2-203ENST00000443575 1942 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC010099.4-201ENST00000424515 1453 ntTSL 5 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR10A6-203ENST00000641238 6052 ntAPPRIS P1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CDY2A-201ENST00000250838 1954 ntAPPRIS ALT1 BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SETX-201ENST00000224140 11100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC00907-201ENST00000585627 3324 ntTSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 NFE2L2-206ENST00000446151 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.71□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 PDE4D-202ENST00000317118 2599 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TINAG-201ENST00000259782 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TMEM161B-211ENST00000512429 1796 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CTNNA2-202ENST00000361291 3071 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL121759.1-201ENST00000434043 795 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL354793.1-201ENST00000446028 713 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CASP12-206ENST00000446862 1196 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL603882.1-201ENST00000463059 681 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OARD1-207ENST00000468811 819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL035690.1-201ENST00000490892 383 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC018680.1-201ENST00000513332 875 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC004052.1-201ENST00000514327 567 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC109466.1-202ENST00000523648 748 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AP003086.3-201ENST00000527030 365 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC008056.2-201ENST00000553812 551 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC01895-201ENST00000558690 404 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 C15orf41-204ENST00000562877 764 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RN7SL753P-201ENST00000581238 290 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 GTSCR1-201ENST00000582578 470 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL589745.2-201ENST00000616366 555 ntTSL 4 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC002044.3-201ENST00000623314 541 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC069542.2-201ENST00000624816 216 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC02246-206ENST00000630211 712 ntTSL 5 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SLMAP-208ENST00000449503 4027 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 KCNMB3P1-202ENST00000493696 3389 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNF4-214ENST00000511600 4123 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RASGRP1-203ENST00000450598 2296 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR2T5-201ENST00000641363 2525 ntAPPRIS P1 BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 BACH1-201ENST00000286800 5669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MFSD8-219ENST00000641228 2559 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SMAP1-206ENST00000619054 3150 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MATR3-215ENST00000510056 3040 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 ZNF573-201ENST00000339503 2014 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC00700-201ENST00000413603 2097 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR1L4-201ENST00000259466 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SNORA70H-201ENST00000383910 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SNORA70J-201ENST00000384182 135 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNASE9-202ENST00000404716 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR2W4P-201ENST00000406496 926 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC003991.1-210ENST00000434733 1048 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AL356309.2-201ENST00000454034 719 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC245041.2-201ENST00000479781 376 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC008592.4-201ENST00000509999 450 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNASE9-205ENST00000553706 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC068722.1-202ENST00000559600 655 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC012564.1-201ENST00000636802 557 ntTSL 4 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MPHOSPH9-220ENST00000606320 6351 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 NRDC-213ENST00000539524 3417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MKL2-202ENST00000571589 8799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 SUN3-203ENST00000412142 1448 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 CACNA2D3-210ENST00000490478 3557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 YPEL5-201ENST00000261353 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 USMG5-201ENST00000309579 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNA5SP394-201ENST00000364216 119 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
HOXA13P31271 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.5 ms