Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 AC096677.2-201ENST00000430471 598 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL645936.2-201ENST00000430565 928 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC009970.1-201ENST00000444873 432 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC016489.1-201ENST00000461109 375 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 RPL7AP23-201ENST00000482625 776 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC124893.1-201ENST00000496247 545 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 CKMT2-AS1-206ENST00000511495 585 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC02506-201ENST00000513211 734 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC103831.1-201ENST00000522228 422 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC008055.1-201ENST00000547032 609 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
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LINC00587B1AMM8 MIR7854-201ENST00000620068 65 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC087894.3-201ENST00000623682 349 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TBC1D19-205ENST00000511789 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
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LINC00587B1AMM8 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 KIAA0895-201ENST00000297063 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MAPRE2-211ENST00000589699 4080 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC063923.1-201ENST00000478982 1619 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 STAG2-202ENST00000371144 4281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
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LINC00587B1AMM8 RNA5SP422-201ENST00000516778 111 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 COX6B1P4-201ENST00000519826 484 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 OR4A17P-201ENST00000526032 904 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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LINC00587B1AMM8 AC023906.3-201ENST00000559825 874 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC009021.1-201ENST00000566098 375 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MTCYBP13-201ENST00000578634 1093 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 MIR4786-201ENST00000583954 80 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL031777.2-201ENST00000611953 196 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 5S_rRNA.23-201ENST00000612086 102 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AL669830.1-201ENST00000621457 656 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 PGAM1P5-203ENST00000626376 313 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
LINC00587B1AMM8 AC024475.3-203ENST00000634971 854 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
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