Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 HAND2-AS1-233ENST00000515345 797 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC092332.1-201ENST00000563684 829 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC002519.2-203ENST00000567043 837 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC139099.1-201ENST00000573737 976 ntTSL 1 (best) BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SEPT4-AS1-202ENST00000580589 653 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OR7A8P-201ENST00000595427 913 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC124916.2-201ENST00000604416 224 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC02362-201ENST00000608785 516 ntTSL 3 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC092681.3-201ENST00000609463 678 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL021918.2-201ENST00000613415 194 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL161457.2-201ENST00000629181 630 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 HDAC9-203ENST00000406072 4102 ntTSL 5 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 CFAP57-204ENST00000528956 3037 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC6.92□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 KIAA1841-205ENST00000453873 4294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NLRP11-201ENST00000589093 3417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 UPRT-207ENST00000530743 1636 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FILIP1L-202ENST00000354552 3970 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC099506.1-201ENST00000567359 4037 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 STMN1-202ENST00000374291 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL359885.1-201ENST00000415786 903 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC114803.1-201ENST00000417355 311 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PLA2G12AP2-201ENST00000424744 264 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL354893.1-201ENST00000433735 348 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GAPDHP75-201ENST00000433910 943 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 BMS1P10-201ENST00000443754 1120 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL157777.1-201ENST00000468100 304 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC02339-201ENST00000472649 752 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 MIR2117-201ENST00000516780 80 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC022784.5-201ENST00000522241 437 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PCED1B-AS1-203ENST00000547626 420 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC103996.3-201ENST00000553477 442 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 INO80-AS1-201ENST00000558967 312 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TXNP4-201ENST00000575018 310 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC022211.1-201ENST00000579554 717 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL136084.2-213ENST00000585704 690 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC003682.1-201ENST00000599190 462 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC093388.1-201ENST00000609166 430 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL136228.1-201ENST00000622221 319 ntBASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 NOL4-202ENST00000535384 1853 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ORC4-215ENST00000536575 6328 ntTSL 2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.91□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AQP9-201ENST00000219919 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 CLEC12B-202ENST00000396502 3029 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 IKZF2-210ENST00000451136 9344 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 KIF16B-202ENST00000355755 606 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 IFNB1-201ENST00000380232 859 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 OOSP1-201ENST00000398992 1270 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PPP1R7-203ENST00000401987 820 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC079080.1-201ENST00000479841 822 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 Metazoa_SRP.158-201ENST00000487171 294 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC117386.2-203ENST00000489690 557 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 TRPT1-216ENST00000546133 382 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AC090826.1-203ENST00000569235 490 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 GARSP1-201ENST00000570895 719 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
GTF3C6Q969F1 AP001357.1-201ENST00000586304 1053 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms