Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 OR4K1-201ENST00000285600 1076 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNF170-202ENST00000319073 1265 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 HYPM-201ENST00000341016 501 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CSAG4-201ENST00000361201 755 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF705B-201ENST00000400120 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01424-201ENST00000417820 1031 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC019050.1-201ENST00000418508 492 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR6K4P-201ENST00000423179 955 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL19P21-201ENST00000424919 591 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PAICSP2-201ENST00000429118 1150 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PMCHL1-204ENST00000430902 659 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 EIF2B5-202ENST00000432569 984 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC091132.2-201ENST00000433601 769 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL023584.1-201ENST00000437067 349 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01133-202ENST00000443364 1266 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC017006.2-201ENST00000444077 464 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC022387.1-201ENST00000444770 794 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RSU1P1-201ENST00000453416 441 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MIR4500HG-204ENST00000453832 827 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TUBB4BP2-201ENST00000454125 798 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CREM-220ENST00000463314 964 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RN7SL352P-201ENST00000466002 277 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CADM2-AS2-201ENST00000467225 768 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 UCK2-205ENST00000469256 753 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02505-201ENST00000505298 788 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNU6-319P-201ENST00000516025 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IGHVIII-38-1-201ENST00000521454 282 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC123767.1-204ENST00000523523 273 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC084880.4-201ENST00000538405 577 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SNHG1-223ENST00000545440 754 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC144548.1-201ENST00000549577 324 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC00929-203ENST00000556213 713 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 NDUFA3P4-201ENST00000560814 250 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC120498.6-201ENST00000564700 338 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SPINT1-AS1-204ENST00000568419 629 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC008551.1-201ENST00000575612 405 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CSAG4-202ENST00000583763 237 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC243960.3-202ENST00000599770 594 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC108451.2-201ENST00000603875 538 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL356986.1-201ENST00000604085 341 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC034236.3-201ENST00000605999 461 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC017076.1-201ENST00000607613 578 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TTR-204ENST00000610404 1040 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AP003068.4-201ENST00000623192 802 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01427-203ENST00000635277 781 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 EXOC1L-202ENST00000636125 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL36AP21-202ENST00000639134 430 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC044839.1-206ENST00000635559 1324 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01931-201ENST00000295052 1832 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SMG1P5-202ENST00000529428 4219 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 SMG1P2-201ENST00000566127 4221 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 OR14C36-201ENST00000317861 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 C22orf15-202ENST00000382821 646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 TRAJ38-201ENST00000390499 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 RPL7AP72-201ENST00000417266 768 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 HLA-DQB1-AS1-201ENST00000419852 552 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL627308.2-201ENST00000420014 432 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC096669.1-201ENST00000422203 648 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 EIF3IP1-201ENST00000433048 967 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
VAMP3Q15836 AL359265.1-201ENST00000440296 795 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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