Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 NOSTRIN-207ENST00000445023 1569 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RAP1GDS1-202ENST00000339360 2092 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR11H1-201ENST00000252835 982 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC004386.1-201ENST00000393214 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 BX284632.2-201ENST00000421091 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC096775.1-201ENST00000437724 448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL512605.1-202ENST00000441919 381 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL359955.2-201ENST00000445380 353 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RNU1-88P-201ENST00000459274 128 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL122020.1-201ENST00000472287 459 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC099521.1-201ENST00000482557 334 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC090103.1-201ENST00000520386 485 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC078899.1-201ENST00000521432 1185 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC027369.2-201ENST00000528030 440 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC091078.2-201ENST00000557145 559 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC073964.1-201ENST00000558938 308 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC009087.1-201ENST00000561827 369 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC005288.1-201ENST00000582842 860 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC092070.2-201ENST00000597550 545 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF528-211ENST00000598192 625 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 Metazoa_SRP.70-201ENST00000612622 273 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC024884.1-201ENST00000620583 399 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CTAGE5-217ENST00000557038 2869 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 UBE3A-205ENST00000566215 3176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 KIAA2012-204ENST00000498697 3772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CASP10-202ENST00000286186 5928 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR8G5-203ENST00000641992 1560 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CASC15-207ENST00000607048 1634 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF266-207ENST00000592904 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 OR5M8-201ENST00000327216 1047 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RXFP1-203ENST00000343542 2130 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TRBV23-1-201ENST00000390396 347 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 VN1R12P-201ENST00000403778 876 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CYP2AC1P-201ENST00000407830 1173 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC00396-201ENST00000411690 439 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 C1orf140-201ENST00000434398 645 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC00380-201ENST00000442478 353 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL049649.1-201ENST00000444792 1105 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC025458.1-201ENST00000506046 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 GAPDHP71-201ENST00000511530 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC097537.1-201ENST00000514864 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LINC01234-204ENST00000550905 589 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 MIR4420-201ENST00000583944 77 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AP001267.4-201ENST00000602598 545 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AC009237.12-201ENST00000604755 742 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 AL137789.1-204ENST00000623503 666 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF729-201ENST00000601693 3877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NOSTRIN-201ENST00000317647 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 TERB1-203ENST00000558713 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ANGPTL5-201ENST00000334289 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PPP2R5E-202ENST00000422769 3478 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 C17orf78-203ENST00000611038 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 LGALSL-202ENST00000409537 3298 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 NOL4-203ENST00000538587 1979 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 PAK3-202ENST00000360648 2241 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
TAF1AQ15573 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.2 ms