Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC007750.1-202ENST00000418968 4098 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CCAR1-217ENST00000543719 3521 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ICE2P1-201ENST00000512800 1849 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SNTN-201ENST00000343837 1090 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 FCGR1B-202ENST00000369383 570 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC009965.1-201ENST00000411436 570 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC018878.1-201ENST00000419904 433 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL133268.4-201ENST00000424868 472 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01501-201ENST00000427523 409 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 FTO-202ENST00000431610 707 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL513348.1-201ENST00000435554 440 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL356121.1-201ENST00000442911 156 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 XXYLT1-AS2-202ENST00000447975 784 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPS23P9-201ENST00000448848 438 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL157371.1-201ENST00000451910 394 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC004890.1-201ENST00000461005 181 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPS7P10-201ENST00000464254 603 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC084211.1-201ENST00000473893 328 ntTSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC023794.2-201ENST00000504891 528 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC004063.1-201ENST00000508358 547 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02512-201ENST00000509548 429 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02196-201ENST00000512838 568 ntTSL 4 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RNA5SP434-201ENST00000516647 121 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR7E158P-201ENST00000524483 910 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR56A7P-201ENST00000524865 941 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 BCAS2P1-201ENST00000528022 632 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC009387.1-201ENST00000549163 441 ntTSL 3 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LYRM1-208ENST00000567954 460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC112491.1-201ENST00000602890 248 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF195-201ENST00000005082 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LGALS8-204ENST00000352231 1402 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SGIP1-203ENST00000371037 7768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TEK-205ENST00000615002 4666 ntTSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.14□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RAD23B-202ENST00000416373 3835 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TOR1AIP1-202ENST00000435319 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PLCH1-202ENST00000340059 6168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SCGB1D4-201ENST00000358585 439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 FPGT-TNNI3K-201ENST00000370893 1195 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 CD52-201ENST00000374213 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 GNAT3-201ENST00000398291 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL133260.1-201ENST00000405720 405 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 SULT1C2-204ENST00000409880 1206 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RN7SKP38-201ENST00000410782 309 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL807757.2-201ENST00000416455 779 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC004012.1-201ENST00000416593 534 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL391097.2-201ENST00000435057 485 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL32-206ENST00000435983 620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC010086.1-201ENST00000437359 1052 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC01322-202ENST00000494915 594 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR4A42P-201ENST00000531397 938 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AP001893.3-201ENST00000532357 569 ntTSL 4 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OTX2-203ENST00000554559 715 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC6.13□□□□□ -1.43
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CUL1Q13616 LINC00907-202ENST00000585639 915 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 VDAC1P8-204ENST00000589489 997 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ZNF208-204ENST00000599916 740 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC005479.3-201ENST00000602790 431 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 WBP1LP12-201ENST00000604449 331 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 IGKV2OR2-1-201ENST00000605129 304 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AC015819.1-201ENST00000613588 663 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 AL445670.1-201ENST00000618889 801 ntBASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 DDAH1-204ENST00000535924 3909 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 KMT5B-215ENST00000615954 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 MIR4500HG-201ENST00000436290 1675 ntTSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RAPH1-204ENST00000418114 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 RAPH1-205ENST00000419464 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 OR56A4-204ENST00000641835 3613 ntAPPRIS P1 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 KCNJ16-205ENST00000586462 1897 ntTSL 5 BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.13□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
CUL1Q13616 ADGRF5-201ENST00000265417 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.12□□□□□ -1.43
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