Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL133329.1-201ENST00000437466 478 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AL133319.1-201ENST00000447848 777 ntTSL 1 (best) BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC211433.1-201ENST00000450426 686 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC104233.1-201ENST00000458107 339 ntTSL 5 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC245088.1-201ENST00000486508 384 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 RPL5P14-201ENST00000494197 878 ntBASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC245519.1-201ENST00000522799 512 ntTSL 4 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC024224.2-201ENST00000544225 782 ntTSL 3 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 BTN3A2-203ENST00000396934 3672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.37□□□□□ -1.39
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SP140Q13342 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
SP140Q13342 NREP-223ENST00000515855 801 ntTSL 4 BASIC6.36□□□□□ -1.39
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