Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W1

Gm3839, Glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3839S4R1W1 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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Gm3839S4R1W1 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3839S4R1W1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Gm3839S4R1W1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gm3839S4R1W1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
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