Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Knop1Q9Z2Q2 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Knop1Q9Z2Q2 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms