Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX5

Skp1, S-phase kinase-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skp1Q9WTX5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Skp1Q9WTX5 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Skp1Q9WTX5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms