Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P1

Psmb3, Proteasome subunit beta type-3, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb3Q9R1P1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Psmb3Q9R1P1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms