Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Irx4Q9QY61 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms