Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Rad18Q9QXK2 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rad18Q9QXK2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms