Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rabgef1Q9JM13 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rabgef1Q9JM13 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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