Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLJ2

Aldh9a1, 4-trimethylaminobutyraldehyde dehydrogenase, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh9a1Q9JLJ2 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Aldh9a1Q9JLJ2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms