Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pkd2l2Q9JLG4 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pkd2l2Q9JLG4 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms