Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKQ4

Irx5, Iroquois-class homeodomain protein IRX-5, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx5Q9JKQ4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Irx5Q9JKQ4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms