Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK1

Stx6, Syntaxin-6, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx6Q9JKK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Stx6Q9JKK1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Stx6Q9JKK1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms