Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Mrpl39Q9JKF7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Mrpl39Q9JKF7 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms