Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pus3Q9JI38 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pus3Q9JI38 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms