Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Capn12Q9ER56 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Capn12Q9ER56 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms