Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ44

Vmn1r41, Vomeronasal type-1 receptor 41, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r41Q9EQ44 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r41Q9EQ44 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vmn1r41Q9EQ44 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms