Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Aph1cQ9DCZ9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms