Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Ap3s1Q9DCR2 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ap3s1Q9DCR2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms