Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Hmgn3Q9DCB1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Hmgn3Q9DCB1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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