Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cnot8Q9D8X5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cnot8Q9D8X5 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms