Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4930513O06RikQ9D549 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
4930513O06RikQ9D549 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms