Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clvs1Q9D4C9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Clvs1Q9D4C9 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms