Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Tmed11Q9D2R4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms