Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0N8

Tmem88, Transmembrane protein 88, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem88Q9D0N8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem88Q9D0N8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Tmem88Q9D0N8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tmem88Q9D0N8 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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