Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ49

Klhl35, Kelch-like protein 35, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl35Q9CZ49 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Klhl35Q9CZ49 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Klhl35Q9CZ49 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms