Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWW7

Cxxc1, CXXC-type zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxxc1Q9CWW7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cxxc1Q9CWW7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cxxc1Q9CWW7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms