Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Tdrd12Q9CWU0 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms