Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ndufb9Q9CQJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms