Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

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Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab5aQ9CQD1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Rab5aQ9CQD1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rab5aQ9CQD1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Rab5aQ9CQD1 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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