Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Commd4Q9CQ02 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Commd4Q9CQ02 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms