Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ubxn6Q99PL6 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn6Q99PL6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms