Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
RetnQ99P87 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
RetnQ99P87 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms