Protein–RNA interactions for Protein: Q99P25

Tsnaxip1, Translin-associated factor X-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsnaxip1Q99P25 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tsnaxip1Q99P25 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms